Généralités

Dans une démarche d’écologie fonctionnelle, l’UMR Eco&Sols pose  les questions (1) du rôle des organismes du sol et des plantes, ainsi que des interactions entre eux et avec leur milieu, dans les cycles biogéochimiques au sein des sols et des agro-écosystèmes, et (2) du devenir des contaminants biologiques (Bt, prions, virus) dans les sols.

La description, la compréhension et la prédiction des flux couplés de C, N et P, ont pour objectif finalisé la maîtrise de ces flux afin de parvenir à une production soutenue et durable des agro-écosystèmes, i.e. une production compatible avec la fourniture de services environnementaux comme la séquestration du carbone. L’identification de stratégies d’ingénierie écologique est centrée sur la maîtrise des communautés fonctionnelles (plantes, organismes du sol) et leurs interactions. La compréhension des fonctions de la biodiversité (microorganismes, nématodes, macrofaune, racines de végétaux) pour la mise en place d’une agriculture écologiquement intensive est l’un des objectifs centraux de l’UMR Eco&Sols.

L’UMR propose trois thématiques de recherche :

1. Sols, activités et réseaux biologiques,
2. Nutriments et intensification écologique,
3. Carbone et changements globaux.

Le premier thème, animé par E. Blanchart (IRD) et C. Plassard (INRA), est résolument tourné vers l’étude de la biodiversité fonctionnelle dans les sols. Seize chercheurs et quinze ingénieurs et techniciens travaillent sur cette thématique. Dans un milieu donné (climat, sol, usages et modes de gestion), les communautés microbiennes responsables de la minéralisation des matières organiques à l’origine des flux de C, N et P, sont régulées par : (i) des organismes bactérivores et fongivores (comme les nématodes), (ii) des organismes ingénieurs (comme les vers de terre) qui modifient l’environnement physique et la disponibilité des ressources, (iii) la quantité, la qualité et la localisation de la matière organique et (iv) les déterminants abiotiques. L’amélioration de notre connaissance de la diversité fonctionnelle des organismes du sol et la prise en compte d’une part des interactions entre organismes au sein d’assemblages complexes et d’autre part des déterminants abiotiques des processus biologiques sont au coeur des travaux de ce thème de recherche.

Les recherches mettent en oeuvre des approches expérimentales de laboratoire (en microcosmes et mésocosmes) et de terrain. Ces démarches expérimentales sont très fortement associées à une recherche d’indicateurs du fonctionnement des agrosystèmes et à une démarche de modélisation dédiée à la formalisation des processus biologiques déterminant le fonctionnement des sols. Ces études sont menées dans des contextes pédo-climatiques contrastés, méditerranéens et tropicaux (Sénégal, Burkina Faso, Madagascar, Kenya, Thaïlande), dans le cadre de collaborations avec des institutions du Nord et des centres nationaux de recherche agronomique et des universités du Sud.

La thématique de recherche sur la biodiversité repose sur des plateaux techniques de pointe, avec notamment un laboratoire dédié à l’étude des protéines, un laboratoire de biologie (principalement pour l’étude des nématodes du sol) et deux laboratoires de biologie moléculaire à Montpellier et à Dakar.

Rôle de l’équipe dans PEPITES

Coordination Tâche 1 (à compléter)

Autres activités développées sur la thématique AC

à compléter

Publications récentes sur le thème :

Blanchart E., Villenave C., Viallatoux A., Barthès B., Girardin C., Azontonde A., Feller C., 2006. Long-term effect of a legume cover crop (Mucuna pruriens var. utilis ) on the communities of soil macrofauna and nematofauna, under maize cultivation, in southern Benin. European Journal of Soil Biology 42: S136-S144.

Blanchart E., Bernoux M., Sarda X., Siqueira Neto M., Cerri C.C., Piccolo M., Douzet J.M., Scopel E., Feller C., 2007. Effect of Direct Seeding Mulch-Based Systems on Soil Carbon Storage and Macrofauna in Central Brazil. Agriculturae Conspectus Scientificus , 72, 1, 81-87.

Rabary B., Sall S. , Letourmy P., Husson O. , Ralambofetra E., Moussa N., Chotte J-L, 2008. Effects of living mulches or residue amendments on soil microbial properties in direct seeded cropping systems of Madagascar. Applied Soil Ecology , 39, 236-243.

Razafimbelo T., Albrecht A., Oliver R., Chevallier T., Chapuis-Lardy L. and Feller C., 2008. Aggregate associated-C and physical protection in a tropical clayey soil under Malagasy conventional and no-tillage systems. Soil & Tillage Research , 98: 140-149

Chapuis-Lardy L., Wrage N., Metay A., Chotte J.L. & Bernoux M. (2007). Soils, a sink for N2O? A review. Global Change Biology , 13, 1-17.