Objectif de la tâche

Etudier l’impact des pratiques agricoles mises en œuvre en AC sur certains organismes du sol et d’analyser l’impact de ces changements de biocénose et de biotope sur certains processus écologiques.

Le choix de ces organismes et de ces processus étudiés est dicté par la volonté (1) de fournir des connaissances sur le rôle fonctionnel des organismes du sol qui pourront être remobilisées sur les autres tâches du projet (2) de fournir des indicateurs biologiques d’état et de fonctionnement du sol pertinents pour la gestion de ces agrosystèmes et l’évaluation des services écosystémiques : biodiversité, dynamique de la matière organique, cycles bio-géochimiques. On s’intéressera notamment aux communautés d’ingénieurs du sol qui participent à la décomposition et à l’incorporation des résidus organiques, de nématodes connues pour être un bon indicateur du fonctionnement microbien, de pathogènes qui peuvent être favorisés par l’AC et de microorganismes impliqués dans le cycle de l’azote et du carbone. Ces études seront menées sur des situations expérimentales et des parcelles d’agriculteurs choisies à l’issue de l’activité 0.4 (Cf § 7) de manière à étudier ces processus génériques sur une diversité de situations en terme de conditions pédo-climatiques, de pratiques et d’âge du système en AC.

Activités

Activité 1.1 : Indicateurs biologiques du fonctionnement des sols en AC

On s’intéresse à fournir des indicateurs portant sur la densité, la biomasse et la diversité des groupes fonctionnels de macrofaune (géophages, détritivores, pathogènes, prédateurs…) et de nématodes. D’un point de vue microbien, on caractérise, en mésocosmes, dans des situations modèles, la structure et la densité les communautés fonctionnelles liées aux cycles du C (saprophytes champignon, actinomycètes) et de l’azote (communautés nitrifiantes, dénitrifiantes) en lien avec la tâche 2. Le choix d’indicateurs spécifiques, pertinents pour la gestion de ces agrosystèmes est raisonné en concertation avec les partenaires scientifiques et les acteurs de terrain dans le cadre de l’activité 0.4. La macrofaune du sol est échantillonnée selon la méthode TSBF (Anderson & Ingram, 1993). Les organismes du sol sont extraits manuellement de monolithes de sol. Les nématodes seront collectés à partir d’échantillons composites de sol grâce à la méthode d’élutriation de Seinhorst ; ils seront ensuite comptés puis fixés et identifiés (groupes taxonomiques et fonctionnels).

Activité 1.2 : Rôle de la faune du sol dans le fonctionnement des sols en AC

Les résultats issus de l’activité 1.1 permettront de définir des situations d’intérêt pour étudier plus spécifiquement le rôle de certains groupes d’organismes sur le fonctionnement du sol sous AC. On pense notamment aux vers de terre et aux larves de Coléoptères qui apparaissent généralement comme les organismes dont les populations sont le plus stimulées par l’absence de travail du sol et la présence de mulch en surface (Blanchart et al. , 2007). On étudiera en mésocosmes de terrain l’effet de ces organismes (en comparaison avec des témoins sans organismes) sur la décomposition et l’enfouissement des mulch, la protection physique de la matière organique et la diversité et l’activité des microorganismes impliqués dans les cycles de C et N. L’utilisation de résidus marqués C13 permettra de mieux comprendre le rôle de ces organismes dans la dynamique de la matière organique.

Partenaires

Membres de PEPITES impliqués dans la Tâche 1 : 

• ALBRECHT Alain, DR2 IRD, UMR Eco&Sols, Pédologie, dynamique de la matière organique (en relation avec tâche 2)
• BERNARD Laetitia, CR2 IRD, UMR Eco&Sols, Ecologie du sol, microorganismes du sol
• BRAUMAN Alain, DR2 IRD, UMR Eco&Sols, Ecologie du sol, microorganismes du sol
• BROSSARD Michel, DR2 IRD, UMR Eco&Sols, Ecologie du sol, macrofaune du sol
• BRUNET Didier, IR IRD, UMR Eco&Sols, Spectroscopie infrarouge (en relation avec tâche 2)
• CHAPUIS-LARDY Lydie, CR1 IRD, UMR Eco&Sols, Ecologie du sol, cycle azote et activités biologiques
• LEANDRO MARCHAO Robèlio, chercheur EMBRAPA, Ecologie du sol, macrofaune du sol
• PABLO Anne-Laure, AI IRD, UMR Eco&Sols, analyses moléculaires
• PEIGNE Joséphine, enseignant-chercheur, ISARA, Ecologie du sol, macrofaune du sol
• RABARY Bodo, chercheur FOFIFA, Ecologie du sol, macrofaune du sol
• RANDRIAMANANTSOA Richard, chercheur FOFIFA, Ecologie du sol, macrofaune du sol
• VIAN Jean-François, enseignant-chercheur, ISARA, Ecologie du sol, microorganismes du sol
• VILLENAVE Cécile, CR1 IRD, UMR Eco&Sols, Ecologie du sol, nématofaune du sol